| Mucin | Species | Protein | Length | mRNA | DNA | Note | |||||||||||||||||||||||||||
| 1 | human | fasta | domain | 1255 | fasta | Chr1q22- | fasta | NCBI reference: AAA60019(mRNA: J05582). | |||||||||||||||||||||||||
| Variant CT58 | domain | plain | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Variant CT80 | domain | plain | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Variant SEC | domain | plain | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Variant X | domain | plain | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Variant Y | domain | plain | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Variant ZD | domain | plain | |||||||||||||||||||||||||||||||
| 2 | human | fasta | domain | 5130 | fasta | Chr11p15.5+ | fasta | NCBI reference: MH593786.1 (protein AZL49145.1) entered by us is CORRECT. The sequences has been published in Frida Svensson et al. (2018) Scientific Reports 8, 17503. NOTE: UNIPROT is wrong. | |||||||||||||||||||||||||
| 3A | human | fasta | domain | 5679 | fasta | Chr7q22.1+ | fasta | T2T-CHM13v2.0 | |||||||||||||||||||||||||
| 3B | human | fasta | domain | 13477 | fasta | Chr7q22.1+ | fasta | T2T-CHM13v2.0 | |||||||||||||||||||||||||
| Variant SEC | fasta | domain | >2281 | fasta | The 2nd exon after PTS is alternative spliced out and the protein stops at the 4th exon after PTS. NCBI reference: AAC02272(mRNA: AF007194). | ||||||||||||||||||||||||||||
| 4 | human | fasta | domain | 5284 | fasta | Chr3q29- | fasta | NCBI reference: CAB81773(mRNA: AJ276359), NP_060876(mRNA: NM_018406), AAA63230(mRNA: M64594). | |||||||||||||||||||||||||
| 5AC | human | fasta | domain | 5654 | Chr11p15.5+ | fasta | NCBI reference for the whole protein: NP_001291288.1 | ||||||||||||||||||||||||||
| 5B | human | fasta | domain | 5703 | Chr11p15.5+ | Genomic DNA and mRNA are missing. NCBI reference: Q9HC84. | |||||||||||||||||||||||||||
| 6 | human | fasta | domain | 5534 | fasta | Chr11p15.5- | fasta | NCBI reference: MH593786.1 (protein at AZL49144.1) entered by us is CORRECT. The sequences has been published in Frida Svensson et al. (2018) Scientific Reports 8, 17503. NOTE UNIPROT is wrong. | |||||||||||||||||||||||||
| 7 | human | fasta | domain | 377 | fasta | Chr4q13.3+ | fasta | NCBI reference: AAH25688(mRNA: BC025688). | |||||||||||||||||||||||||
| 8 | human | fasta | 2699 | fasta | Chr12q24- | Not mucin protein although called MUC8 (no signal sequence). NCBI reference: AAX21802(mRNA: AY945262). | |||||||||||||||||||||||||||
| 9 | OVGP1(oviductal glycoprotein 1). NCBI reference: NP_002548(mRNA: NM_002557). | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 10 | Only found in mouse. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 11 | Part of MUC12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 12 | human | fasta | domain | 11309 | fasta | Chr7q22.1+ | fasta | T2T-CHM13v2.0 | |||||||||||||||||||||||||
| 13 | human | fasta | domain | 512 | fasta | Chr3q21.2- | fasta | NCBI reference: NP_149038(mRNA: NM_016885). | |||||||||||||||||||||||||
| 14 | human | fasta | domain | 261 | fasta | Chr4q23- | fasta | NCBI reference: Q9ULC0(mRNA: NM_016242) | |||||||||||||||||||||||||
| 15 | human | fasta | domain | 334 | fasta | Chr11p14.2- | fasta | NCBI reference: CAD_10624(mRNA: AJ417818). | |||||||||||||||||||||||||
| 16 | human | fasta | domain | >22152 | fasta | Chr19p13.2- | Missing signal sequence. NCBI reference: AAL65133(mRNA: AF414442). | ||||||||||||||||||||||||||
| 17 | human | fasta | domain | 4493 | fasta | Chr7q22.1+ | fasta | NCBI reference: CAE54435(mRNA: AJ606307). | |||||||||||||||||||||||||
| 18 | MCAM(melanoma cell adhesion molecule ). NCBI reference: NP_006491(mRNA: NM_006500). | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 19 | human | fasta | domain | >4858 | fasta | Chr12q12+ | fasta | PTS+Cterm, N-term is missing. NCBI reference: AAP41817(mRNA: AY236870). Ensembl reference: Version 21.34d :ENSP00000298914(DNA: ENSG00000165960), ENSP00000331564(DNA: ENSG00000165960), ENSP00000331707(DNA: ENSG00000165960). | |||||||||||||||||||||||||
| 20 | human | fasta | domain | 709 | fasta | Chr3q29+ | NCBI reference: AAH44243(mRNA: BC044243). | ||||||||||||||||||||||||||
| 21 | human | fasta | domain | 566 | fasta | Chr6p21.33+ | fasta | NCBI reference: BAF92842.1(mRNA: AB242595.1). | |||||||||||||||||||||||||
| 22 | human | fasta | domain | 1773 | fasta | Chr6p21.33+ | fasta | NCBI Reference Sequence: AC_000138.1 Chromosome 6 (mRNA gi|311771748|ref|NM_001198815.1) | |||||||||||||||||||||||||
| HEG | human | fasta | domain | 1333 | fasta | Chr3q21.2- | fasta | NCBI reference: BAA86551(mRNA: AB033063). | |||||||||||||||||||||||||
| EXPLANTION OF ANNOTATION | |||||||||||||||||||||||||||||||||