Mucin |
Species |
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Protein |
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mRNA |
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DNA |
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1 |
human |
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fasta |
domain |
1255 |
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fasta |
Chr1q22- |
fasta |
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NCBI reference: AAA60019(mRNA: J05582). |
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Variant CT58 |
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domain |
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plain |
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Variant CT80 |
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domain |
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plain |
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Variant SEC |
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domain |
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plain |
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Variant X |
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domain |
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plain |
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Variant Y |
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domain |
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plain |
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Variant ZD |
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domain |
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plain |
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2 |
human |
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fasta |
domain |
5130 |
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fasta |
Chr11p15.5+ |
fasta |
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NCBI reference: MH593786.1 (protein AZL49145.1) entered by us is CORRECT. The sequences has been published in Frida Svensson et al. (2018) Scientific Reports 8, 17503. NOTE: UNIPROT is wrong. |
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3A |
human |
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fasta |
domain |
5679 |
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fasta |
Chr7q22.1+ |
fasta |
|
T2T-CHM13v2.0 |
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3B |
human |
|
fasta |
domain |
13477 |
|
fasta |
Chr7q22.1+ |
fasta |
|
T2T-CHM13v2.0 |
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Variant SEC |
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fasta |
domain |
>2281 |
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fasta |
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The 2nd exon after PTS is alternative spliced out
and the protein stops at the 4th exon after PTS. NCBI reference:
AAC02272(mRNA: AF007194). |
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4 |
human |
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fasta |
domain |
5284 |
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fasta |
Chr3q29- |
fasta |
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NCBI reference: CAB81773(mRNA: AJ276359),
NP_060876(mRNA: NM_018406), AAA63230(mRNA: M64594). |
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5AC |
human |
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fasta |
domain |
5654 |
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Chr11p15.5+ |
fasta |
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NCBI reference for the whole protein:
NP_001291288.1 |
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5B |
human |
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fasta |
domain |
5703 |
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Chr11p15.5+ |
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Genomic DNA and mRNA are missing. NCBI reference:
Q9HC84. |
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6 |
human |
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fasta |
domain |
5534 |
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fasta |
Chr11p15.5- |
fasta |
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NCBI reference: MH593786.1 (protein at AZL49144.1) entered by us is CORRECT. The sequences has been published in Frida Svensson et al. (2018) Scientific Reports 8, 17503. NOTE UNIPROT is wrong. |
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7 |
human |
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fasta |
domain |
377 |
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fasta |
Chr4q13.3+ |
fasta |
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NCBI reference: AAH25688(mRNA: BC025688). |
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8 |
human |
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fasta |
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2699 |
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fasta |
Chr12q24- |
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Not mucin protein although called MUC8 (no
signal sequence). NCBI reference: AAX21802(mRNA: AY945262). |
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9 |
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OVGP1(oviductal glycoprotein 1). NCBI reference:
NP_002548(mRNA: NM_002557). |
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10 |
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Only found in mouse. |
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11 |
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Part of MUC12 |
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12 |
human |
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fasta |
domain |
11309 |
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fasta |
Chr7q22.1+ |
fasta |
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T2T-CHM13v2.0 |
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13 |
human |
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fasta |
domain |
512 |
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fasta |
Chr3q21.2- |
fasta |
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NCBI reference: NP_149038(mRNA: NM_016885). |
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14 |
human |
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fasta |
domain |
261 |
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fasta |
Chr4q23- |
fasta |
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NCBI reference: Q9ULC0(mRNA: NM_016242) |
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15 |
human |
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fasta |
domain |
334 |
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fasta |
Chr11p14.2- |
fasta |
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NCBI reference: CAD_10624(mRNA: AJ417818). |
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16 |
human |
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fasta |
domain |
>22152 |
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fasta |
Chr19p13.2- |
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Missing signal sequence. NCBI reference:
AAL65133(mRNA: AF414442). |
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17 |
human |
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fasta |
domain |
4493 |
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fasta |
Chr7q22.1+ |
fasta |
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NCBI reference: CAE54435(mRNA: AJ606307). |
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18 |
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MCAM(melanoma cell adhesion molecule ). NCBI
reference: NP_006491(mRNA: NM_006500). |
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19 |
human |
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fasta |
domain |
>4858 |
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fasta |
Chr12q12+ |
fasta |
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PTS+Cterm, N-term is missing. NCBI reference:
AAP41817(mRNA: AY236870). Ensembl reference: Version 21.34d
:ENSP00000298914(DNA: ENSG00000165960), ENSP00000331564(DNA:
ENSG00000165960), ENSP00000331707(DNA: ENSG00000165960). |
20 |
human |
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fasta |
domain |
709 |
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fasta |
Chr3q29+ |
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NCBI reference: AAH44243(mRNA: BC044243). |
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21 |
human |
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fasta |
domain |
566 |
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fasta |
Chr6p21.33+ |
fasta |
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NCBI reference: BAF92842.1(mRNA: AB242595.1). |
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22 |
human |
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fasta |
domain |
1773 |
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fasta |
Chr6p21.33+ |
fasta |
¡¡ |
NCBI Reference Sequence: AC_000138.1 Chromosome 6
(mRNA gi|311771748|ref|NM_001198815.1) |
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HEG |
human |
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fasta |
domain |
1333 |
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fasta |
Chr3q21.2- |
fasta |
NCBI reference: BAA86551(mRNA: AB033063). |
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EXPLANTION OF ANNOTATION |
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